Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia1B2RXQ2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms