Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clrn2B2RVW2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Clrn2B2RVW2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms