Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zscan5bB2RTN3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zscan5bB2RTN3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms