Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc22a28B2RT89 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms