Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rrn3B2RS91 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rrn3B2RS91 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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