Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otud4B2RRE7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms