Protein–RNA interactions for Protein: B2RQT2

Vmn1r5, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r5B2RQT2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r5B2RQT2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r5B2RQT2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms