Protein–RNA interactions for Protein: B1AZQ8

Cldn34b1, Claudin 34B1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b1B1AZQ8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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Cldn34b1B1AZQ8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34b1B1AZQ8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Cldn34b1B1AZQ8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Cldn34b1B1AZQ8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Cldn34b1B1AZQ8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34b1B1AZQ8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms