Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NhsB1AV60 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NhsB1AV60 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NhsB1AV60 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms