Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trabd2bB1ATG9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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