Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc38A3KMP2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc38A3KMP2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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