Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc9bA3KGF9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc9bA3KGF9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms