Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms