Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al1jA2BFR3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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