Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klhl41A2AUC9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms