Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Upf2A2AT37 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms