Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Syndig1A2ANU3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms