Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT6

Vmn1r2, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r2A2AMT6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r2A2AMT6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r2A2AMT6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r2A2AMT6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r2A2AMT6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r2A2AMT6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r2A2AMT6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r2A2AMT6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r2A2AMT6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r2A2AMT6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms