Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem185aA2AF53 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms