Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1bA1Z198 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms