Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms