Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms