Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms