Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXN4

Ighv1-18, Immunoglobulin heavy variable V1-18 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms