Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm44007-201ENSMUST00000203845 2189 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Anapc1-203ENSMUST00000110333 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Pgbd1-205ENSMUST00000151743 2642 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm29154-258ENSMUST00000217560 1733 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Ap3b2-201ENSMUST00000082090 3804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Piwil4-203ENSMUST00000115644 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Pcdhb11-201ENSMUST00000053073 4419 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Wdr27-206ENSMUST00000228330 2759 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Trpv1-202ENSMUST00000102526 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 AC153548.1-201ENSMUST00000219283 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Rin3-204ENSMUST00000133820 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 4833420G17Rik-203ENSMUST00000224312 3406 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm7534-201ENSMUST00000097849 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Myo1f-201ENSMUST00000087605 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm17575-201ENSMUST00000180437 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gtf2a1-201ENSMUST00000021345 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Cacna1c-213ENSMUST00000188078 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Cacna1c-217ENSMUST00000188865 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Cldn18-201ENSMUST00000035048 4172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Grik2-201ENSMUST00000079751 2610 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 AC159379.2-201ENSMUST00000220244 2482 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Rimbp2-205ENSMUST00000199537 6966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Rufy3-207ENSMUST00000199312 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Olfr156-204ENSMUST00000215406 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Arhgef7-202ENSMUST00000074856 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 BC049715-203ENSMUST00000203499 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm35172-201ENSMUST00000196037 2649 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 1500026H17Rik-201ENSMUST00000181598 3027 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm43800-201ENSMUST00000201868 2731 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm10600-201ENSMUST00000117202 2047 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Prkd3-202ENSMUST00000118768 2847 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Crebbp-205ENSMUST00000205765 7749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Exoc5-207ENSMUST00000162175 12699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Zfp964-201ENSMUST00000169125 1416 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Dpp6-203ENSMUST00000120555 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm43846-201ENSMUST00000200502 932 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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