Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm37549-201ENSMUST00000194096 4065 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm38352-201ENSMUST00000194459 2557 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Akap8-201ENSMUST00000002699 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Trpc7-202ENSMUST00000109871 3519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Fgr-201ENSMUST00000030693 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Cd101-201ENSMUST00000147399 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Btbd11-202ENSMUST00000105306 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Acpp-202ENSMUST00000112590 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Cul2-201ENSMUST00000025073 3727 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Cenpi-202ENSMUST00000101251 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Kpna3-201ENSMUST00000022496 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Olfr1509-202ENSMUST00000205900 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Prpf40a-208ENSMUST00000210789 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm16465-201ENSMUST00000118585 1758 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Myt1-201ENSMUST00000081125 5327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Cd68-202ENSMUST00000108654 1008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Myl2-201ENSMUST00000014080 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Cdk15-202ENSMUST00000160662 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Dxo-208ENSMUST00000174092 738 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm9142-201ENSMUST00000187161 955 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm17867-201ENSMUST00000188981 391 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm42429-201ENSMUST00000198579 558 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm17910-201ENSMUST00000211038 838 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm29807-201ENSMUST00000220161 372 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Ambra1-201ENSMUST00000045699 4690 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm22362-201ENSMUST00000083102 134 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Foxp3-203ENSMUST00000115739 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm28813-201ENSMUST00000186293 1497 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm29324-202ENSMUST00000188242 1497 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Cdh13-201ENSMUST00000117160 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Naip1-201ENSMUST00000022142 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Olfr1532-ps1-202ENSMUST00000207492 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Olfr1532-ps1-203ENSMUST00000215949 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm15066-201ENSMUST00000120163 2608 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Steap4-201ENSMUST00000115421 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm26629-201ENSMUST00000180848 2276 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Sorbs1-211ENSMUST00000224667 4313 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Prpf4b-201ENSMUST00000077853 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Trub1-202ENSMUST00000026073 3795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Elp3-201ENSMUST00000022609 2851 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Ppwd1-201ENSMUST00000022226 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Ldb2-207ENSMUST00000199534 2541 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Mpp7-201ENSMUST00000115869 4975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gatb-204ENSMUST00000127348 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gpr83-202ENSMUST00000115624 2937 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Ank3-231ENSMUST00000182884 9963 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Kif18b-201ENSMUST00000021311 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Snx17Q8BVL3 Cth-201ENSMUST00000118539 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Snx17Q8BVL3 Rab43-201ENSMUST00000032134 4308 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Tlr5-201ENSMUST00000110997 3199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm17235-201ENSMUST00000169128 964 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm5539-201ENSMUST00000192177 966 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm3011-201ENSMUST00000215669 582 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Snx17Q8BVL3 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms