Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gm29080-201ENSMUST00000188565 356 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm28944-201ENSMUST00000188946 356 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm28908-201ENSMUST00000189002 356 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm29078-201ENSMUST00000190611 356 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm37825-201ENSMUST00000193141 904 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm34217-201ENSMUST00000193562 356 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm36996-201ENSMUST00000194466 250 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm30275-201ENSMUST00000197620 498 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm42889-201ENSMUST00000199480 660 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Olfr1389-201ENSMUST00000203369 1073 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm16475-202ENSMUST00000209033 528 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm34574-202ENSMUST00000219433 1108 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Olfr51-201ENSMUST00000076514 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 BC049715-203ENSMUST00000203499 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Prss35-201ENSMUST00000036426 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Fam217a-201ENSMUST00000021851 2402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Foxn1-201ENSMUST00000108294 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 2310001H17Rik-202ENSMUST00000181238 2237 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 C130093G08Rik-201ENSMUST00000202489 2226 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm7694-201ENSMUST00000179801 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Ankrd45-202ENSMUST00000111608 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Vezt-203ENSMUST00000118205 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Phc3-210ENSMUST00000177992 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Zkscan5-202ENSMUST00000085671 3794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm12394-201ENSMUST00000107981 3348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Platr30-202ENSMUST00000199348 1934 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Ctsc-203ENSMUST00000131108 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Pnlip-201ENSMUST00000057270 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Duxbl2-201ENSMUST00000100810 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm12187-201ENSMUST00000119584 1375 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Npffr2-201ENSMUST00000048557 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Celf2-223ENSMUST00000182851 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Wls-201ENSMUST00000068952 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Smim23-202ENSMUST00000109365 331 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Rgs8-204ENSMUST00000111814 678 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Bambi-ps1-201ENSMUST00000121525 592 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm371-201ENSMUST00000142240 1245 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm17122-201ENSMUST00000166047 372 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Lgals1-ps2-201ENSMUST00000170221 519 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm7031-201ENSMUST00000173709 919 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Cpsf6-208ENSMUST00000177145 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm8307-201ENSMUST00000187682 1150 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm28864-201ENSMUST00000189251 644 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm43560-201ENSMUST00000198100 773 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm42775-201ENSMUST00000198407 740 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm44285-201ENSMUST00000203557 940 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Olfr471-201ENSMUST00000210091 936 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Spaca7-203ENSMUST00000210276 715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm45283-201ENSMUST00000210593 628 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 AC158799.1-201ENSMUST00000214686 617 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm21321-201ENSMUST00000220179 446 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 AC124196.1-201ENSMUST00000225970 1032 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Apoa2-201ENSMUST00000005824 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm38014-201ENSMUST00000193349 2612 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Lars2-201ENSMUST00000038863 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Eftud2-201ENSMUST00000021306 3324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Lmx1a-201ENSMUST00000028003 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Olfr1115-203ENSMUST00000214119 2455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Aldh18a1-207ENSMUST00000176939 3427 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Ica1l-206ENSMUST00000191251 3415 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Gm44423-201ENSMUST00000203746 3158 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Trp53i11Q4QQM4 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms