Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Pik3r4-210ENSMUST00000191268 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm17130-201ENSMUST00000201542 2683 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm28593-201ENSMUST00000190989 2170 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm44007-201ENSMUST00000203845 2189 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Ttc41-203ENSMUST00000217747 1949 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Ank2-201ENSMUST00000044443 5775 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm37633-201ENSMUST00000192858 2700 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Itgam-201ENSMUST00000064821 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 D630045J12Rik-206ENSMUST00000169256 10968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Bmpr1b-201ENSMUST00000029948 5349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Adamtsl1-209ENSMUST00000141889 7805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Pdgfra-201ENSMUST00000000476 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Kbtbd4-201ENSMUST00000090682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Pdgfra-208ENSMUST00000202681 2876 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Olfr523-204ENSMUST00000214272 3780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Btnl10-203ENSMUST00000108818 1028 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Btnl10-201ENSMUST00000020792 1028 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Olfr209-204ENSMUST00000213779 564 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 AC124397.1-201ENSMUST00000224296 653 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 AC134913.1-201ENSMUST00000224563 504 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 CT009733.1-202ENSMUST00000224941 441 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 1600015I10Rik-201ENSMUST00000031837 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 AI429214-201ENSMUST00000098825 1930 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Nav2-216ENSMUST00000184945 10665 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Pcdhb3-201ENSMUST00000051754 3787 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Tnfrsf23-202ENSMUST00000152703 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Zic4-201ENSMUST00000066384 3891 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Esrrg-201ENSMUST00000027906 5293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Satb1-203ENSMUST00000129667 2896 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Cops2-203ENSMUST00000110463 3392 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Olfr156-204ENSMUST00000215406 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Bivm-202ENSMUST00000114709 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Piwil4-203ENSMUST00000115644 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Drp2-206ENSMUST00000153424 7135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Olfr433-202ENSMUST00000214690 2968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Luzp4-202ENSMUST00000163338 2025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 2600014E21Rik-201ENSMUST00000186411 4805 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Fam168a-205ENSMUST00000207875 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Cttnbp2-201ENSMUST00000090601 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm5761-201ENSMUST00000119238 834 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm13936-201ENSMUST00000130416 715 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Fxyd5-207ENSMUST00000161684 1172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Olfr270-202ENSMUST00000172257 939 ntAPPRIS P2 BASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm37920-201ENSMUST00000192952 749 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms