Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Prps1l1-201ENSMUST00000134550 1676 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Ccser2-209ENSMUST00000183038 1681 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Bdnf-202ENSMUST00000111042 3905 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Ift46-202ENSMUST00000118186 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gca-201ENSMUST00000028257 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Dbt-201ENSMUST00000000349 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 9530052C20Rik-201ENSMUST00000181882 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm42737-201ENSMUST00000201074 1755 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 9430073C21Rik-201ENSMUST00000145346 2173 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 4930543E12Rik-202ENSMUST00000210408 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm5316-202ENSMUST00000185734 3096 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Kin-201ENSMUST00000042512 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Tmod2-203ENSMUST00000164100 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm44874-201ENSMUST00000206586 1542 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Spx-204ENSMUST00000211094 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr806-202ENSMUST00000213239 3724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Apol10b-201ENSMUST00000089465 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm16223-201ENSMUST00000087332 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Scn3b-201ENSMUST00000049941 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Hdhd2-207ENSMUST00000147332 1705 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Map4k4-215ENSMUST00000195259 3719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Magi2-215ENSMUST00000208219 3266 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm26569-201ENSMUST00000181968 1789 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm14336-201ENSMUST00000117491 475 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm12445-201ENSMUST00000117947 885 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm12361-201ENSMUST00000119806 1044 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm15571-201ENSMUST00000119887 637 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm11258-201ENSMUST00000121086 1218 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm15694-201ENSMUST00000121984 283 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm11953-201ENSMUST00000122352 1003 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm40614-201ENSMUST00000125161 1254 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm13546-202ENSMUST00000138444 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm21454-201ENSMUST00000178599 1285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm26612-201ENSMUST00000180785 1055 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm28609-201ENSMUST00000186515 463 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Scgb2b4-ps-201ENSMUST00000186705 340 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm29561-201ENSMUST00000187838 631 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm3142-201ENSMUST00000190107 414 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm37929-201ENSMUST00000195116 493 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm37904-201ENSMUST00000195591 312 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm37555-201ENSMUST00000195711 542 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm6394-201ENSMUST00000197077 477 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm43013-201ENSMUST00000198216 247 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm43069-201ENSMUST00000201006 859 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm45698-201ENSMUST00000208537 1135 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm45554-201ENSMUST00000210731 1004 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Lilrb4a-215ENSMUST00000220182 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm32089-201ENSMUST00000221222 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 AC156576.1-201ENSMUST00000222315 500 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm32834-202ENSMUST00000222417 655 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 AC107663.2-201ENSMUST00000225534 1234 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 AC160930.2-201ENSMUST00000226608 303 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Plac8-201ENSMUST00000031264 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Hist1h1t-201ENSMUST00000041052 912 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr90-201ENSMUST00000070808 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr38-201ENSMUST00000074499 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm10036-201ENSMUST00000079733 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Snora57-201ENSMUST00000093658 148 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm16026-201ENSMUST00000094774 580 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Cldn34b1-201ENSMUST00000096852 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Itgb1bp2-201ENSMUST00000033674 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Il31ra-206ENSMUST00000224510 2946 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Tcf7l2-211ENSMUST00000111658 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Zfp40-201ENSMUST00000037057 4103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms