Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
DmdP11531 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
DmdP11531 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
DmdP11531 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
DmdP11531 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
DmdP11531 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
DmdP11531 Lrrc29-204ENSMUST00000210801 3830 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
DmdP11531 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
DmdP11531 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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DmdP11531 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
DmdP11531 Ttll1-203ENSMUST00000109480 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
DmdP11531 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
DmdP11531 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
DmdP11531 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
DmdP11531 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
DmdP11531 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
DmdP11531 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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DmdP11531 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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DmdP11531 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
DmdP11531 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
DmdP11531 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
DmdP11531 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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DmdP11531 Wdr48-208ENSMUST00000217472 2997 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
DmdP11531 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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DmdP11531 9930014A18Rik-202ENSMUST00000181910 4116 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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DmdP11531 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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DmdP11531 Lcn2-201ENSMUST00000050785 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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DmdP11531 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
DmdP11531 Iqcg-202ENSMUST00000115100 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
DmdP11531 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
DmdP11531 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
DmdP11531 Rasgrp4-201ENSMUST00000032811 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
DmdP11531 Rasgrp4-202ENSMUST00000094617 4617 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
DmdP11531 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
DmdP11531 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
DmdP11531 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DmdP11531 Mertk-201ENSMUST00000014505 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms