Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Gm37145-201ENSMUST00000193540 2756 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Allc-201ENSMUST00000020965 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm12904-201ENSMUST00000117451 1399 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Schip1-207ENSMUST00000182997 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm25095-201ENSMUST00000104047 131 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm14519-201ENSMUST00000118490 312 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 F730035M05Rik-201ENSMUST00000145871 1296 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Ttc9c-204ENSMUST00000153281 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gzmg-201ENSMUST00000015578 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Nup37-202ENSMUST00000169309 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm8877-201ENSMUST00000172657 655 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm18353-201ENSMUST00000185906 784 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm29491-201ENSMUST00000189481 506 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Spata45-202ENSMUST00000192151 443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm38087-201ENSMUST00000193653 265 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm37185-201ENSMUST00000193852 410 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Ighv8-16-201ENSMUST00000199258 294 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm6375-201ENSMUST00000205201 1145 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm40723-201ENSMUST00000219407 603 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm10054-201ENSMUST00000223362 431 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 AC167013.6-201ENSMUST00000226587 1067 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Med6-201ENSMUST00000002756 1003 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Olfr2-201ENSMUST00000094109 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Erp44-201ENSMUST00000030028 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm44746-201ENSMUST00000205565 1349 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 0610031O16Rik-203ENSMUST00000185046 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Smok3c-202ENSMUST00000178402 1515 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Tpbpa-201ENSMUST00000021885 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm25762-201ENSMUST00000103984 132 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm5761-201ENSMUST00000119238 834 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm12870-201ENSMUST00000121383 1016 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm11662-201ENSMUST00000121389 1193 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm12121-201ENSMUST00000131630 500 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Kbtbd8os-201ENSMUST00000135145 427 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 BC049715-202ENSMUST00000163640 744 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm3275-201ENSMUST00000169145 487 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.5 ms