Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm12220-201ENSMUST00000118476 172 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm15369-201ENSMUST00000119681 394 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm12180-201ENSMUST00000120905 661 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm11520-201ENSMUST00000122837 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 1700092C02Rik-201ENSMUST00000134397 359 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm11300-201ENSMUST00000137651 565 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm16238-201ENSMUST00000159343 586 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm16103-201ENSMUST00000163003 1279 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Rasgef1b-207ENSMUST00000166484 1296 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm18822-201ENSMUST00000182857 1025 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm7456-201ENSMUST00000182862 1011 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Mir6909-201ENSMUST00000184212 62 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 1700084F23Rik-201ENSMUST00000186662 1044 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 4930512B01Rik-202ENSMUST00000188608 983 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm38358-201ENSMUST00000195144 428 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm43069-201ENSMUST00000201006 859 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm6072-201ENSMUST00000203989 496 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm44714-201ENSMUST00000208665 657 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 CT030709.1-201ENSMUST00000214443 443 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 AC154264.2-201ENSMUST00000216569 403 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm18623-201ENSMUST00000219860 953 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 AC157772.1-201ENSMUST00000226266 365 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 AC114585.2-203ENSMUST00000228400 339 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Slurp2-201ENSMUST00000057932 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Cenph-201ENSMUST00000075550 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm26264-201ENSMUST00000083278 159 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm2163-201ENSMUST00000179734 2723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm3269-201ENSMUST00000166025 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Ceacam1-202ENSMUST00000098668 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Zfp85os-201ENSMUST00000049518 2624 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Vmn2r96-202ENSMUST00000177244 1995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Musk-207ENSMUST00000177951 3352 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Musk-204ENSMUST00000098059 3352 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TtrP07309 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm7978-202ENSMUST00000201129 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 BC061212-201ENSMUST00000094587 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Rps19-ps2-201ENSMUST00000100614 438 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 n-R5s1-201ENSMUST00000101925 119 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm14336-201ENSMUST00000117491 475 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm12312-201ENSMUST00000120351 644 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm15694-201ENSMUST00000121984 283 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 A630023P12Rik-201ENSMUST00000129007 1221 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Rpl21-ps8-201ENSMUST00000130005 478 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 9430024E24Rik-201ENSMUST00000130532 713 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Pitpnm2os2-202ENSMUST00000162577 744 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Rps19-ps1-201ENSMUST00000168472 438 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm20451-201ENSMUST00000173452 273 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Pon1-203ENSMUST00000176945 619 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm27199-201ENSMUST00000185026 623 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm28478-201ENSMUST00000185802 183 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm6308-201ENSMUST00000203226 313 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm18988-201ENSMUST00000205601 746 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm34397-201ENSMUST00000213192 708 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 AC159899.1-201ENSMUST00000214024 733 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 AC121788.2-201ENSMUST00000218284 1255 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm6129-201ENSMUST00000220725 801 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 AC142227.1-201ENSMUST00000221371 621 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 AC170810.2-201ENSMUST00000228384 1232 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TtrP07309 Ly6f-201ENSMUST00000023247 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms