Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Cyp24a1-201ENSMUST00000038824 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Spata1-202ENSMUST00000093951 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Igkv14-130-201ENSMUST00000103307 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm24542-201ENSMUST00000103870 110 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Ap5s1-202ENSMUST00000110206 703 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm14682-201ENSMUST00000117977 524 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm13921-201ENSMUST00000119411 463 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm11955-201ENSMUST00000119801 470 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm13586-201ENSMUST00000121784 464 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 1700030A11Rik-201ENSMUST00000125317 888 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Rpl29-203ENSMUST00000150576 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm23598-201ENSMUST00000157262 144 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm6871-204ENSMUST00000171059 462 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm17157-201ENSMUST00000172397 348 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 H2-Aa-204ENSMUST00000174751 826 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm23403-201ENSMUST00000179169 110 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Trav5d-4-201ENSMUST00000179701 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Trav5n-4-201ENSMUST00000179997 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Pea15b-202ENSMUST00000183185 555 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm27224-201ENSMUST00000184749 564 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Ssxb8B1AY40 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 AC118476.4-201ENSMUST00000215385 790 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 AC158239.1-201ENSMUST00000216890 779 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm18783-201ENSMUST00000220465 1151 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Mir187-201ENSMUST00000083598 61 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Mir146b-201ENSMUST00000093619 109 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Csnk1g1-209ENSMUST00000205379 4001 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Ssxb8B1AY40 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 3110009F21Rik-201ENSMUST00000223217 1625 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Ssxb8B1AY40 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Entpd5-205ENSMUST00000120942 4881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Ssxb8B1AY40 AC241621.1-201ENSMUST00000224499 430 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Ssxb8B1AY40 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Ssxb8B1AY40 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ssxb8B1AY40 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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