Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Dnajb5-202ENSMUST00000084662 3302 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Hnf4g-201ENSMUST00000108393 2224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 9230112J17Rik-201ENSMUST00000216749 2333 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm15709-201ENSMUST00000118354 213 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm16573-203ENSMUST00000162231 807 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm4259-201ENSMUST00000206489 758 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Cd37-208ENSMUST00000210372 960 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm15704-201ENSMUST00000144757 2818 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Plec-205ENSMUST00000073418 15455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Morc2b-201ENSMUST00000053896 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Slmapos2-201ENSMUST00000160089 2194 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 6820431F20Rik-202ENSMUST00000153748 4659 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Il31ra-206ENSMUST00000224510 2946 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Acsl1-203ENSMUST00000110372 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Ace2-201ENSMUST00000073973 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Nin-211ENSMUST00000222237 9919 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 St7-206ENSMUST00000115417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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OtofQ9ESF1 Gm15192-201ENSMUST00000121005 293 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm24050-201ENSMUST00000158623 290 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm17083-201ENSMUST00000165849 1366 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm8204-201ENSMUST00000185696 2144 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Supt7l-204ENSMUST00000201769 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Tex21-201ENSMUST00000021453 2137 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Olfr353-202ENSMUST00000215925 1615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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OtofQ9ESF1 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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OtofQ9ESF1 Nrip1-202ENSMUST00000121927 7868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Adgrl3-218ENSMUST00000122037 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Sh3bgrl2-201ENSMUST00000113215 4565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Tnfrsf19-202ENSMUST00000111236 3958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Ttc41-203ENSMUST00000217747 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Ces3a-202ENSMUST00000093223 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Wls-201ENSMUST00000068952 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Jakmip2-201ENSMUST00000082254 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Tcf7l2-211ENSMUST00000111658 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 CT009515.4-201ENSMUST00000228165 1494 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Phc3-210ENSMUST00000177992 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Zfp946-201ENSMUST00000088763 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Ergic2-208ENSMUST00000136008 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Card11-201ENSMUST00000085786 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Lamb3-201ENSMUST00000016315 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
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OtofQ9ESF1 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Nucb1-210ENSMUST00000211765 4853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Umps-201ENSMUST00000023510 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Clasp1-205ENSMUST00000185405 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Scn2b-202ENSMUST00000170998 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Tmem144-201ENSMUST00000029568 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 BC025920-201ENSMUST00000099442 2785 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Smc2-201ENSMUST00000102915 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm17867-201ENSMUST00000188981 391 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm18631-201ENSMUST00000223125 1043 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Gm4673-201ENSMUST00000181395 3660 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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