Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Supt7l-204ENSMUST00000201769 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Olfr224-204ENSMUST00000217009 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Cacna2d4-205ENSMUST00000186622 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Tktl1-201ENSMUST00000010127 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm37465-201ENSMUST00000192845 3290 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 2010110K18Rik-201ENSMUST00000181453 2400 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Txnip-202ENSMUST00000074519 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gem-201ENSMUST00000029868 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Rbm12-202ENSMUST00000109604 6635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm35572-201ENSMUST00000212427 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Olfr545-202ENSMUST00000216116 3496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm44812-201ENSMUST00000207627 5349 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm36799-201ENSMUST00000214113 1737 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Tcf23-201ENSMUST00000006818 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Zmynd8-206ENSMUST00000109269 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Faf2-203ENSMUST00000126071 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Ipcef1-201ENSMUST00000078070 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Clasp1-205ENSMUST00000185405 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Olfr353-202ENSMUST00000215925 1615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Hfe-202ENSMUST00000091706 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Arhgef7-202ENSMUST00000074856 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm13750-201ENSMUST00000117621 465 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm37920-201ENSMUST00000192952 749 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm18980-201ENSMUST00000199098 1079 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Speer9-ps1-201ENSMUST00000203447 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 3632451O06Rik-202ENSMUST00000118129 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm16316-201ENSMUST00000154065 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm10069-201ENSMUST00000144745 3694 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Ambra1-202ENSMUST00000045705 5203 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Def8-204ENSMUST00000108830 3191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gucy1b3-204ENSMUST00000193597 3171 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Arhgap17-211ENSMUST00000207010 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Vmn2r92-201ENSMUST00000169686 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 A430110L20Rik-202ENSMUST00000181680 2513 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Supt5-201ENSMUST00000003527 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Bdp1-204ENSMUST00000109379 7567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Zdhhc22-202ENSMUST00000222543 3462 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 L3mbtl2-201ENSMUST00000023029 3487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Nol12-203ENSMUST00000138880 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm38014-201ENSMUST00000193349 2612 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Trp63-201ENSMUST00000040231 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm27435-201ENSMUST00000183588 88 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm29145-201ENSMUST00000189914 456 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Washc2-201ENSMUST00000036759 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm44013-201ENSMUST00000204392 2262 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Eif2ak4-202ENSMUST00000102527 4906 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Tmod3-201ENSMUST00000072232 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Trim21-202ENSMUST00000106913 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Dclre1b-202ENSMUST00000063502 4113 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Ulk4-201ENSMUST00000051479 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm12695-201ENSMUST00000107071 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gabrq-202ENSMUST00000114553 4943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Brip1os-201ENSMUST00000128960 4423 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Ppp1r9a-204ENSMUST00000168998 2966 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 AC160637.1-201ENSMUST00000214037 3887 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Cblb-205ENSMUST00000227756 3378 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 AC170188.1-201ENSMUST00000223710 1963 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm12834-201ENSMUST00000121855 2829 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm45873-201ENSMUST00000211865 1915 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm4907-202ENSMUST00000163718 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms