Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Pacsin2-202ENSMUST00000165095 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 D6Wsu163e-201ENSMUST00000032497 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Smarca1-203ENSMUST00000101616 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Cep112-206ENSMUST00000130515 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Kalrn-204ENSMUST00000114949 3618 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm8728-201ENSMUST00000207367 2178 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm8486-201ENSMUST00000207508 2171 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm8685-201ENSMUST00000207567 2183 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm16443-201ENSMUST00000207909 2184 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 AC114002.1-201ENSMUST00000218097 2409 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm26633-201ENSMUST00000180546 3256 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Olfr954-202ENSMUST00000214818 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Supt5-201ENSMUST00000003527 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Slc12a1-201ENSMUST00000028630 4645 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm44684-201ENSMUST00000205388 2926 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Fmo5-202ENSMUST00000107049 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Scn8a-204ENSMUST00000108909 11436 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Nemp1-201ENSMUST00000048099 6002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm43322-201ENSMUST00000196232 1612 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Tpbpa-201ENSMUST00000021885 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Sub1-201ENSMUST00000022816 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Ubqln3-201ENSMUST00000057254 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Grhl3-201ENSMUST00000105855 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Synj2-205ENSMUST00000115786 2531 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Polr3a-201ENSMUST00000026322 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Fam228a-204ENSMUST00000222363 2284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Clasp1-221ENSMUST00000191823 3916 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Ctf2-201ENSMUST00000076091 1754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Def8-204ENSMUST00000108830 3191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Rpgr-203ENSMUST00000073392 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm25803-201ENSMUST00000104419 131 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Lyg1-202ENSMUST00000114894 798 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm13536-201ENSMUST00000132913 766 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm12708-202ENSMUST00000136941 1046 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm16235-201ENSMUST00000146132 342 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Itih5l-ps-202ENSMUST00000148862 808 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm27150-201ENSMUST00000183441 1038 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm27228-201ENSMUST00000184500 1038 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm28361-201ENSMUST00000188825 474 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 4930535E02Rik-201ENSMUST00000194463 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 4933417G07Rik-201ENSMUST00000199681 1137 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm44233-201ENSMUST00000203616 226 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 4933407I05Rik-201ENSMUST00000213311 482 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm5668-201ENSMUST00000220897 436 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 AC154598.2-201ENSMUST00000227114 604 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 AC122774.1-201ENSMUST00000227703 762 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm37200-201ENSMUST00000193689 2172 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Dnah9-201ENSMUST00000080665 13798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm35572-201ENSMUST00000212427 2310 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 AC154314.1-201ENSMUST00000223995 2996 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Hspbap1-201ENSMUST00000023555 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Ctnna1-201ENSMUST00000042345 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Cfap43-205ENSMUST00000160247 5264 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm45025-201ENSMUST00000206043 2389 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 D630033O11Rik-205ENSMUST00000210802 2761 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 2010109I03Rik-201ENSMUST00000077004 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Cdk6-202ENSMUST00000165117 11525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm28410-201ENSMUST00000188113 1450 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm14258-201ENSMUST00000144607 2031 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Agbl4-206ENSMUST00000106592 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 AC122829.1-201ENSMUST00000219743 1631 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm40603-202ENSMUST00000219975 1642 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 AC122402.1-201ENSMUST00000225199 2303 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm45903-201ENSMUST00000212891 2898 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 4930407I10Rik-201ENSMUST00000100396 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Wipf3-205ENSMUST00000163746 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Mgat4e-201ENSMUST00000052911 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm26965-201ENSMUST00000167914 1520 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Hnrnpk-224ENSMUST00000224182 2754 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Rnf222-201ENSMUST00000065213 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Gm4849-201ENSMUST00000188428 2246 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Fgr-204ENSMUST00000171223 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 Tdrd5-204ENSMUST00000167528 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm2035J3QP87 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms