Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Tctex1d1-208ENSMUST00000223169 683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Hist1h1t-201ENSMUST00000041052 912 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Olfr45-201ENSMUST00000084454 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm45817-201ENSMUST00000212738 1757 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Me1-202ENSMUST00000185374 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Mgam2-ps-203ENSMUST00000216691 1709 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Zfp551-202ENSMUST00000120220 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Ptafr-201ENSMUST00000070690 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gfm2-209ENSMUST00000161825 4416 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Casp8-203ENSMUST00000190213 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Ldlr-202ENSMUST00000213114 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Rfpl4-201ENSMUST00000045215 1598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Cdh8-204ENSMUST00000142129 2711 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Zmiz2-203ENSMUST00000109785 3542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Phf21a-204ENSMUST00000111290 6332 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 D5Ertd579e-201ENSMUST00000031091 6677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Ctsc-203ENSMUST00000131108 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Dnm3-203ENSMUST00000159763 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Wdcp-206ENSMUST00000223551 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm26903-201ENSMUST00000180749 4583 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Csf3r-202ENSMUST00000106162 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Ubqln3-201ENSMUST00000057254 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm11933-201ENSMUST00000121550 375 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm12120-201ENSMUST00000125068 592 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm12064-201ENSMUST00000133819 533 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm16267-201ENSMUST00000140569 732 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm15833-201ENSMUST00000161563 957 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm27043-201ENSMUST00000182807 958 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Cenpn-205ENSMUST00000212775 837 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm37314-201ENSMUST00000193545 2685 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Agbl4-206ENSMUST00000106592 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Duxbl1-203ENSMUST00000172667 2209 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm26965-201ENSMUST00000167914 1520 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gimap8-201ENSMUST00000078223 3160 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 4930425K24Rik-201ENSMUST00000222054 2143 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm16130-201ENSMUST00000153106 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Clcn7-201ENSMUST00000040729 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 C6-201ENSMUST00000022788 2447 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm42572-201ENSMUST00000202292 3378 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Limk2-203ENSMUST00000101642 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Ctnna1-201ENSMUST00000042345 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm36949-201ENSMUST00000192487 2327 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Trim39-205ENSMUST00000173369 2914 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm12408-206ENSMUST00000211577 1983 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm42847-201ENSMUST00000201732 2553 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Eif2b3-202ENSMUST00000106447 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Slc31a1-201ENSMUST00000084526 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Zp2-201ENSMUST00000033207 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Lrit2-201ENSMUST00000057176 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Ttc29-201ENSMUST00000049395 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Tcaf1-203ENSMUST00000121083 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Prr5l-209ENSMUST00000163762 4159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm43280-201ENSMUST00000202958 1550 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 CT572985.1-201ENSMUST00000220599 4714 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm5622-201ENSMUST00000096170 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm13682-201ENSMUST00000117524 702 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Psph-202ENSMUST00000118268 785 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm14141-201ENSMUST00000120236 783 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm12780-201ENSMUST00000122458 645 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Vmn1r113-202ENSMUST00000173723 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm2404-201ENSMUST00000196197 844 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms