Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 9530013L04Rik-201ENSMUST00000203393 782 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm18192-201ENSMUST00000210174 941 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm35501-201ENSMUST00000213492 783 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Rps25-205ENSMUST00000216867 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm5668-201ENSMUST00000220897 436 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm18629-201ENSMUST00000222496 884 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 AC133189.3-201ENSMUST00000226269 878 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 AC154760.1-201ENSMUST00000227218 673 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 CT009550.3-201ENSMUST00000228542 455 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm34730-201ENSMUST00000210674 4077 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 1700123J17Rik-201ENSMUST00000206035 1805 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Elovl2-202ENSMUST00000117096 3797 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Agtpbp1-206ENSMUST00000164215 4331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Zfp946-201ENSMUST00000088763 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Tmem27-202ENSMUST00000112280 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Cdc14b-202ENSMUST00000109769 2886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Pla2g4d-201ENSMUST00000094665 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm28593-201ENSMUST00000190989 2170 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Lrrc18-201ENSMUST00000038956 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 3110009F21Rik-201ENSMUST00000223217 1625 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Sfmbt1-204ENSMUST00000227303 2960 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rps29P62274 A530041M06Rik-201ENSMUST00000199690 2288 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Itgam-205ENSMUST00000120355 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Birc5-202ENSMUST00000093906 3334 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Cpeb1os1-201ENSMUST00000207156 2112 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm37995-201ENSMUST00000194958 1714 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 AC160340.1-201ENSMUST00000222952 3964 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Arhgap17-211ENSMUST00000207010 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Ces1g-201ENSMUST00000044602 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Clec1a-201ENSMUST00000037481 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Mynn-201ENSMUST00000047502 3394 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Zfp961-201ENSMUST00000109997 2713 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 L3mbtl2-201ENSMUST00000023029 3487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm26429-201ENSMUST00000104829 110 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm13252-201ENSMUST00000119355 321 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm9378-201ENSMUST00000120315 471 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm14414-201ENSMUST00000120833 573 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Banf2os-202ENSMUST00000145504 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm26351-201ENSMUST00000157532 232 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm23533-201ENSMUST00000157540 245 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm23220-201ENSMUST00000158115 137 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm25266-201ENSMUST00000158521 304 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm28126-201ENSMUST00000185286 356 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm5835-201ENSMUST00000185806 1270 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm28421-201ENSMUST00000186378 356 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm28212-201ENSMUST00000187114 356 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm28355-201ENSMUST00000187443 356 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm29568-201ENSMUST00000187884 356 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm29080-201ENSMUST00000188565 356 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms