Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm28469-201ENSMUST00000186374 2166 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm28134-201ENSMUST00000188690 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm37075-201ENSMUST00000191888 2166 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm37574-201ENSMUST00000194264 2166 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Ctc1-201ENSMUST00000021278 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Specc1l-202ENSMUST00000105421 6632 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Umodl1-201ENSMUST00000066554 5007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Cnot2-204ENSMUST00000164088 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Patl2-201ENSMUST00000028665 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm43071-201ENSMUST00000197233 2032 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm12183-201ENSMUST00000120566 1848 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Sf3b3-201ENSMUST00000042012 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Cs-201ENSMUST00000005826 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm29154-211ENSMUST00000213655 1499 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Scn3b-202ENSMUST00000114956 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm4773-201ENSMUST00000120392 702 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm17909-201ENSMUST00000207587 907 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Zfp474-202ENSMUST00000209270 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 1700047G07Rik-202ENSMUST00000212351 842 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Vmn1r64-201ENSMUST00000078475 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Platr30-202ENSMUST00000199348 1934 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Emc1-202ENSMUST00000082262 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Lsamp-202ENSMUST00000099761 8794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm16233-201ENSMUST00000136170 1623 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm42656-201ENSMUST00000201506 2305 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Prokr1-203ENSMUST00000204682 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Frrs1-201ENSMUST00000040260 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Proz-201ENSMUST00000033822 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Ptges-202ENSMUST00000102852 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Filip1-201ENSMUST00000093811 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 D630033O11Rik-205ENSMUST00000210802 2761 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm4919-201ENSMUST00000117825 604 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Cd180-202ENSMUST00000167144 430 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 1700018P08Rik-201ENSMUST00000212522 1239 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm24696-201ENSMUST00000083878 134 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Zic4-201ENSMUST00000066384 3891 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm3147-202ENSMUST00000201071 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 A430089I19Rik-201ENSMUST00000097479 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Sycp1-201ENSMUST00000029448 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Tcf23-201ENSMUST00000006818 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Ntsr1-201ENSMUST00000029084 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Vipas39-201ENSMUST00000021426 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm36120-201ENSMUST00000214393 1734 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Adgrl3-209ENSMUST00000119385 4905 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Dhx30-202ENSMUST00000111991 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm20110-201ENSMUST00000218263 2095 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Pkp4-203ENSMUST00000112577 4222 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 AC112265.1-201ENSMUST00000213522 1501 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Srp54a-201ENSMUST00000021407 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Rora-201ENSMUST00000034766 10878 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Abca8a-201ENSMUST00000046223 5614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm4849-201ENSMUST00000188428 2246 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Stk11ip-201ENSMUST00000027414 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm37980-201ENSMUST00000194420 1910 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
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