Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Gm26628-201ENSMUST00000181028 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Rnf38-204ENSMUST00000107836 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 2610017A05Rik-201ENSMUST00000204670 1661 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 BC039771-202ENSMUST00000144661 2753 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Ap1b1-202ENSMUST00000101613 3735 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Parp9-202ENSMUST00000114877 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Trak2-205ENSMUST00000174120 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Serpinb6a-202ENSMUST00000043552 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Rnf19a-203ENSMUST00000228358 3452 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 D3Ertd751e-208ENSMUST00000192193 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm44257-201ENSMUST00000204469 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Luzp1-207ENSMUST00000170102 7526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 9330121K16Rik-201ENSMUST00000211464 3886 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm8802-201ENSMUST00000118633 740 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm12421-201ENSMUST00000119071 307 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm13683-201ENSMUST00000119497 1076 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm15062-201ENSMUST00000120567 367 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm13999-201ENSMUST00000141511 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Mir6912-201ENSMUST00000184456 70 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm29041-201ENSMUST00000189199 380 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Anapc15-ps-202ENSMUST00000218771 399 ntAPPRIS P5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Spink10-201ENSMUST00000055725 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm16026-201ENSMUST00000094774 580 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Kdm4a-203ENSMUST00000106403 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Sdr42e1-201ENSMUST00000037955 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Col28a1-201ENSMUST00000115537 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Kpna6-202ENSMUST00000102590 5710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Chrm1-201ENSMUST00000035444 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Dcaf11-201ENSMUST00000072530 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Zic4-201ENSMUST00000066384 3891 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Man2b1-201ENSMUST00000034121 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Dbndd2-203ENSMUST00000109349 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm26785-201ENSMUST00000181775 2914 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Ovol1-201ENSMUST00000025861 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Itgb2l-202ENSMUST00000113773 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Nipal4-201ENSMUST00000020679 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gpr85-203ENSMUST00000115492 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gabrb2-201ENSMUST00000007797 3989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Hrh4-201ENSMUST00000041676 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Wdr11-201ENSMUST00000084519 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm10384-201ENSMUST00000100713 2046 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Cd8a-201ENSMUST00000066747 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm3854-201ENSMUST00000207173 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 AC155270.1-201ENSMUST00000221626 4028 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Apex2-201ENSMUST00000026303 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Zfp229-201ENSMUST00000065871 4525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Ipcef1-201ENSMUST00000078070 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Ccdc162-211ENSMUST00000190522 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gria4-201ENSMUST00000027020 5441 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Lmx1a-201ENSMUST00000028003 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Rps19-ps2-201ENSMUST00000100614 438 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm14094-201ENSMUST00000117717 610 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm5761-201ENSMUST00000119238 834 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Rps19-ps1-201ENSMUST00000168472 438 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm17157-201ENSMUST00000172397 348 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm18353-201ENSMUST00000185906 784 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm37155-201ENSMUST00000192152 406 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm44285-201ENSMUST00000203557 940 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm45554-201ENSMUST00000210731 1004 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 AC124577.1-201ENSMUST00000214044 487 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm40638-201ENSMUST00000216422 682 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms