Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm15496-201ENSMUST00000129578 2456 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Mtor-202ENSMUST00000103221 8564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Aldh1l1-203ENSMUST00000130418 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm43890-201ENSMUST00000203437 2799 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Pde6h-202ENSMUST00000137768 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Adgrg1-201ENSMUST00000093271 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Pex5l-210ENSMUST00000193681 3620 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Lin54-202ENSMUST00000123572 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Ikbke-201ENSMUST00000062108 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Lamb3-201ENSMUST00000016315 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Eya3-201ENSMUST00000020197 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm12126-201ENSMUST00000147717 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 A930031H19Rik-202ENSMUST00000153810 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Nrep-203ENSMUST00000171533 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Stat1-206ENSMUST00000186857 4241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Lpin1-205ENSMUST00000221297 3100 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Cd99l2-201ENSMUST00000037391 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm44835-201ENSMUST00000205544 3181 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Htr5a-201ENSMUST00000036227 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Slc13a2os-201ENSMUST00000149865 3627 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Arhgef7-202ENSMUST00000074856 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Ndst2-205ENSMUST00000225000 3661 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Tmem170b-201ENSMUST00000129449 7168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Katnal1-201ENSMUST00000047257 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Rps20-203ENSMUST00000138502 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Limk2-203ENSMUST00000101642 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Bcas3-204ENSMUST00000108056 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Ctns-202ENSMUST00000108476 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Zfp472-201ENSMUST00000039132 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Psg16-201ENSMUST00000071399 4421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nphp4P59240 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms