Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm4956-201ENSMUST00000082032 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Mrgprb4-201ENSMUST00000094388 1219 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm10069-201ENSMUST00000144745 3694 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Fgr-201ENSMUST00000030693 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Adgrl3-216ENSMUST00000121641 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Vmn1r199-202ENSMUST00000227685 5713 ntAPPRIS P2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Tenm4-201ENSMUST00000107162 11021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Pcdh15-225ENSMUST00000149977 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 4930555G01Rik-201ENSMUST00000112770 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm3099-201ENSMUST00000112787 2065 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm21560-201ENSMUST00000168480 2066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm36251-201ENSMUST00000213712 1914 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Arpp21-201ENSMUST00000035085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Glod4-206ENSMUST00000169701 4203 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Myo1e-201ENSMUST00000034745 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Zfp90-205ENSMUST00000212874 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Zfp952-201ENSMUST00000087666 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Trpv5-201ENSMUST00000031901 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Unc5c-201ENSMUST00000075282 3890 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Tvp23a-201ENSMUST00000051118 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 4833420G17Rik-203ENSMUST00000224312 3406 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Fmn1-203ENSMUST00000102547 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Nlrp3-201ENSMUST00000079476 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Prom1-204ENSMUST00000087442 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Fam229b-203ENSMUST00000125042 707 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Prr13-202ENSMUST00000164688 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm17138-201ENSMUST00000165702 459 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm18024-201ENSMUST00000218516 690 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 AC159263.2-201ENSMUST00000221593 411 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Zfp40-201ENSMUST00000037057 4103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 2700046A07Rik-202ENSMUST00000067450 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 March7-201ENSMUST00000067542 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 4930471M09Rik-202ENSMUST00000206475 1990 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Olfr632-203ENSMUST00000214711 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm28352-201ENSMUST00000186654 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm28972-201ENSMUST00000186990 2167 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm29302-201ENSMUST00000187209 2167 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm28866-201ENSMUST00000187298 2167 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm28878-201ENSMUST00000188272 2167 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm28246-201ENSMUST00000188308 2167 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm28823-201ENSMUST00000188540 2167 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm29046-201ENSMUST00000188653 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm28346-201ENSMUST00000189021 2167 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Cacna2d4-205ENSMUST00000186622 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Sncaip-202ENSMUST00000115410 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Pde10a-201ENSMUST00000024647 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Klhl5-201ENSMUST00000101191 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Adgrl2-204ENSMUST00000195988 4541 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Ighj1-201ENSMUST00000103430 53 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm12178-201ENSMUST00000120545 330 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm5931-201ENSMUST00000121308 477 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm16110-201ENSMUST00000161473 892 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm29517-201ENSMUST00000190744 351 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm29654-201ENSMUST00000186886 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm28226-201ENSMUST00000186916 2169 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm5316-202ENSMUST00000185734 3096 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Qrich2-204ENSMUST00000208602 7260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Nsun6-204ENSMUST00000114715 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Foxp3-204ENSMUST00000115740 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Dcp1a-201ENSMUST00000022535 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Nufip1-201ENSMUST00000022586 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm12258-201ENSMUST00000093768 2524 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Cdh3-201ENSMUST00000080797 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Lhx6-202ENSMUST00000112961 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Ikbke-201ENSMUST00000062108 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Card11-201ENSMUST00000085786 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 C78859-201ENSMUST00000212800 5943 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Cldn18-201ENSMUST00000035048 4172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Ptchd1-201ENSMUST00000038665 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm36952-201ENSMUST00000194923 3625 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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