Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm42766-201ENSMUST00000200233 1332 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm13415-201ENSMUST00000131886 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r55-202ENSMUST00000172743 2346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Ebf2-201ENSMUST00000022637 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Igkv6-25-201ENSMUST00000103383 380 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Efcab9-202ENSMUST00000109377 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm4908-201ENSMUST00000121923 1005 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm17572-201ENSMUST00000171455 420 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm20511-201ENSMUST00000174079 456 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm38258-201ENSMUST00000191792 675 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 1700081B01Rik-202ENSMUST00000197543 648 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm18973-201ENSMUST00000205814 511 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm17995-201ENSMUST00000209266 530 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm10451-202ENSMUST00000219367 855 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 AC211878.7-201ENSMUST00000222851 661 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Cenpx-202ENSMUST00000055424 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Olfr319-201ENSMUST00000076965 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Olfr412-201ENSMUST00000077794 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm23037-201ENSMUST00000083874 324 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm16434-201ENSMUST00000100888 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm6676-201ENSMUST00000166493 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Cdc42bpa-218ENSMUST00000212756 5247 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Zwilch-211ENSMUST00000176794 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Rad54l-201ENSMUST00000102704 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Met-201ENSMUST00000080469 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Zfyve9-201ENSMUST00000042185 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Zfp952-201ENSMUST00000087666 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm38251-201ENSMUST00000192968 2575 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Brdt-202ENSMUST00000112677 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 n-R5s1-201ENSMUST00000101925 119 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm13936-201ENSMUST00000130416 715 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Ang-ps1-201ENSMUST00000162314 436 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm8868-201ENSMUST00000173591 577 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 1110059E24Rik-202ENSMUST00000177577 599 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm5435-201ENSMUST00000179295 1150 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm42620-201ENSMUST00000197715 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Lsm5-205ENSMUST00000203958 416 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm44159-201ENSMUST00000204065 442 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Olfr61-204ENSMUST00000211685 1212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Borcs8-201ENSMUST00000002418 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm15433-201ENSMUST00000097671 891 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm36757-201ENSMUST00000221818 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm5721-201ENSMUST00000119845 1696 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Pla2g4c-ps-201ENSMUST00000204668 1364 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Gm3742-201ENSMUST00000220907 1391 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rnft1Q9DCN7 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms