Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm25767-201ENSMUST00000158572 124 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm23823-201ENSMUST00000158740 124 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Glyatl3-201ENSMUST00000166343 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Rasgef1b-207ENSMUST00000166484 1296 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm38306-201ENSMUST00000193954 237 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Iglc1-201ENSMUST00000200568 454 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm45238-201ENSMUST00000210204 517 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm45338-205ENSMUST00000210795 728 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 AC154640.1-204ENSMUST00000227105 648 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 AC122774.1-201ENSMUST00000227703 762 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 4930553J12Rik-201ENSMUST00000023648 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Llcfc1-201ENSMUST00000031900 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 1700010B08Rik-201ENSMUST00000073081 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 6330409D20Rik-201ENSMUST00000009695 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 1700010N08Rik-202ENSMUST00000188166 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Fas-201ENSMUST00000025691 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Plxna2-201ENSMUST00000027952 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Zscan26-202ENSMUST00000110485 4366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Dkc1-201ENSMUST00000033776 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm14188-201ENSMUST00000105060 168 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Psph-202ENSMUST00000118268 785 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm11604-201ENSMUST00000121487 742 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 4930453H23Rik-201ENSMUST00000125569 1719 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 D630023F18Rik-202ENSMUST00000148020 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 Muc13-202ENSMUST00000115044 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 Gm428-201ENSMUST00000084475 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm11238-201ENSMUST00000084479 1323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm21719-202ENSMUST00000189073 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm4275-205ENSMUST00000212624 1436 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Rag1-201ENSMUST00000078494 6608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Mpp7-201ENSMUST00000115869 4975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm25803-201ENSMUST00000104419 131 ntBASIC9□□□□□ -0.97
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