Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 4930441H08Rik-201ENSMUST00000205699 501 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 D830044I16Rik-205ENSMUST00000206296 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Gm18243-201ENSMUST00000220756 887 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 4930428N03Rik-205ENSMUST00000225654 892 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Lcn2-201ENSMUST00000050785 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Olfr1270-201ENSMUST00000099754 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Zscan5b-201ENSMUST00000072662 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Gm28042-202ENSMUST00000129685 4472 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Homer1-204ENSMUST00000102752 5713 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Ccdc33-210ENSMUST00000215944 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Fgd3-202ENSMUST00000110086 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Hsd17b13-201ENSMUST00000048118 1708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Gemin8-204ENSMUST00000130880 1389 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Olfm3-202ENSMUST00000081752 4647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Pde2a-212ENSMUST00000211368 3885 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Msh4-203ENSMUST00000188338 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Adra1a-203ENSMUST00000159365 4118 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Gm38245-201ENSMUST00000191702 2621 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 L3mbtl3-203ENSMUST00000174766 3411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Smoc1-203ENSMUST00000129362 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Gm12774-201ENSMUST00000117881 416 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Gm15465-201ENSMUST00000120368 358 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Gm13049-201ENSMUST00000133196 757 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Gm11707-201ENSMUST00000150366 490 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Gm28115-201ENSMUST00000188985 360 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Gm44767-201ENSMUST00000206634 469 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 AC140409.1-201ENSMUST00000213907 457 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Pafah1b2-203ENSMUST00000214179 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Vmn1r200-201ENSMUST00000074324 1063 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Olfr120-201ENSMUST00000077498 993 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Gm4640-201ENSMUST00000203927 2352 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Gm15931-201ENSMUST00000118066 1852 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Zfp936-203ENSMUST00000202535 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Ppp2r2b-201ENSMUST00000025377 2031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Aldob-201ENSMUST00000029987 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Olfr214-203ENSMUST00000214699 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Olfr214-204ENSMUST00000215846 2605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Cntn4-205ENSMUST00000113261 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Foxp4Q9DBY0 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 Pilra-201ENSMUST00000058897 2578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 Drc3-204ENSMUST00000108723 1917 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 D230017M19Rik-203ENSMUST00000181973 1649 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 Smim1-202ENSMUST00000126119 3996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 Rap1gds1-209ENSMUST00000200396 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 Aoc1-204ENSMUST00000167529 2734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 Gm4349-201ENSMUST00000181809 2559 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 Gm11514-201ENSMUST00000117670 432 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 Gm15021-201ENSMUST00000117832 742 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 Gm5398-201ENSMUST00000121933 984 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Foxp4Q9DBY0 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.4 ms