Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm29507-201ENSMUST00000187378 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Otx2-210ENSMUST00000227404 2086 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Lhx4-201ENSMUST00000027740 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Pex5l-208ENSMUST00000192093 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm24257-201ENSMUST00000104472 131 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm16618-201ENSMUST00000134992 955 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm24327-201ENSMUST00000175108 78 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm26929-201ENSMUST00000182703 753 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm30275-201ENSMUST00000197620 498 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 AC163295.2-202ENSMUST00000227763 1053 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Olfr1378-202ENSMUST00000213259 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Pign-210ENSMUST00000190811 3015 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Fam168a-202ENSMUST00000107042 6388 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gigyf2-217ENSMUST00000174501 3876 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm28077-201ENSMUST00000190250 1635 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 B930018H19Rik-201ENSMUST00000211381 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 AC112265.1-201ENSMUST00000213522 1501 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Scn2b-201ENSMUST00000093855 3958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Zfp445-201ENSMUST00000056467 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm15114-201ENSMUST00000112788 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 9330121K16Rik-201ENSMUST00000211464 3886 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Med12-202ENSMUST00000087956 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm17076-201ENSMUST00000165185 1401 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Calcr-201ENSMUST00000075644 3763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 2610008E11Rik-201ENSMUST00000039271 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm26792-201ENSMUST00000180538 2799 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Fmnl1-203ENSMUST00000107027 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Nrxn3-202ENSMUST00000110130 3654 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Cd300lg-203ENSMUST00000107164 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm28561-201ENSMUST00000189366 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm28732-201ENSMUST00000189632 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm38136-201ENSMUST00000194775 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm38296-201ENSMUST00000195205 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm15028-201ENSMUST00000120295 370 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Phf11d-202ENSMUST00000160425 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Arhgef38-204ENSMUST00000161932 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm21886-201ENSMUST00000178391 645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Trav5d-4-201ENSMUST00000179701 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Trav5n-4-201ENSMUST00000179997 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 4933439J24Rik-201ENSMUST00000200866 853 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm34574-202ENSMUST00000219433 1108 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Timm8b-201ENSMUST00000044051 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm26003-201ENSMUST00000083061 113 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Tacr3-201ENSMUST00000029822 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Lin54-202ENSMUST00000123572 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Olfr923-203ENSMUST00000213619 2846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 1500004A13Rik-202ENSMUST00000183707 6054 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Cdh26-202ENSMUST00000108912 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 4933402N03Rik-201ENSMUST00000070980 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Ctnnd1-216ENSMUST00000111690 5945 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm14144-201ENSMUST00000128602 1721 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Fbxo3-203ENSMUST00000111135 3740 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Tgfb3-201ENSMUST00000003687 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Nrxn3-205ENSMUST00000163134 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Tmem268-202ENSMUST00000080336 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm37121-201ENSMUST00000192219 2556 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Zfp93-202ENSMUST00000108438 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Vmn2r-ps91-201ENSMUST00000213039 784 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 AC124709.1-201ENSMUST00000227296 620 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Gm37069-201ENSMUST00000192742 4142 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
ScaperF8VQ70 Olfr152-203ENSMUST00000215394 2172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms