Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac5Q9Z2V6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hdac5Q9Z2V6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hdac5Q9Z2V6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms