Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdac6Q9Z2V5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac6Q9Z2V5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms