Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms