Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn7Q9Z261 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms